W mysim modelu guzów stabilnych mikrosatelitarnie (MSS) obecność tych bakterii zahamowała wzrost nowotworu i przerzuty. Mechanizm polega na indukcji ekspresji MHC-II w komórkach raka poprzez szlak CIITA. W organoidach ludzkich guzów MSS zwiększona ekspozycja MHC-II nasiliła apoptozę wywołaną przez limfocyty. (preprint, oczekuje recenzji)
Otwiera to drogę do immunoterapii (blokada PD-1/CTLA-4) w opornym dotąd raku jelita grubego





















UniFrac mierzy różnice między próbkami mikrobiomu z uwzględnieniem pokrewieństwa filogenetycznego, ale słabo radzi sobie z dużymi zbiorami. Nowy algorytm DartUniFrac, opisany w Nature Biotechnology, łączy UniFrac z ważoną miarą Jaccarda i wykorzystuje algorytmy szkicowania. Implementacja z akceleracją GPU jest do trzech rzędów wielkości szybsza od klasycznego UniFrac, co pozwala porównywać miliony próbek parami i analizować miliardy taksonów.
Dzięki temu
źródło: card
Pobierz