DartUniFrac przyspiesza porównywanie mikrobiomów nawet tysiąckrotnie, skalując się do milionów próbek i miliardów taksonów. 🧫🧬
UniFrac mierzy różnice między próbkami mikrobiomu z uwzględnieniem pokrewieństwa filogenetycznego, ale słabo radzi sobie z dużymi zbiorami. Nowy algorytm DartUniFrac, opisany w Nature Biotechnology, łączy UniFrac z ważoną miarą Jaccarda i wykorzystuje algorytmy szkicowania. Implementacja z akceleracją GPU jest do trzech rzędów wielkości szybsza od klasycznego UniFrac, co pozwala porównywać miliony próbek parami i analizować miliardy taksonów.
Dzięki temu
UniFrac mierzy różnice między próbkami mikrobiomu z uwzględnieniem pokrewieństwa filogenetycznego, ale słabo radzi sobie z dużymi zbiorami. Nowy algorytm DartUniFrac, opisany w Nature Biotechnology, łączy UniFrac z ważoną miarą Jaccarda i wykorzystuje algorytmy szkicowania. Implementacja z akceleracją GPU jest do trzech rzędów wielkości szybsza od klasycznego UniFrac, co pozwala porównywać miliony próbek parami i analizować miliardy taksonów.
Dzięki temu

















@progilion: Pick one. ( ͡° ͜ʖ ͡°)