Wszystko

Najnowsze

Archiwum

p.....a
p.....a
  • 1
@turkusowakoszulka: ściągasz najpierw sekwencję pierwszego i drugiego enzymu,
wchodzisz na ncbi.nlm.nih.gov/blast
wybierasz nucletotide blast
odhaczas " Align two or more sequences"
Wklejasz sekwencję pierwszą do pierwszego okienka, drugą do drugiego
i przyrównujesz, najlepiej na domyślnych ustawieniach, bo po co kombinować bardziej
  • Odpowiedz
cieliczka
cieliczka
  • 4
Proces starzenia nie jest jednostajny, a znaczące zmiany zachodzą w wieku 34, 60 i 78 lat

Tak wynika z artykułu opublikowanego w Nature Medicine, który opisuje badanie poziomu ok. 3 tysięcy białek w osoczu krwi ponad 4 tysięcy osób w wieku 18-95 lat. Tutaj znalezisko z tłumaczeniem w komentarzu opisującym badanie i jego znaczenie

#liganauki #biologia #bioinformatyka #analizadanych
cieliczka - Proces starzenia nie jest jednostajny, a znaczące zmiany zachodzą w wieku...

źródło: comment_EBW45Sblqwv4B9p8e4pd3MozPEQusOhb.jpg

Pobierz
  • Odpowiedz

  • Otrzymuj powiadomienia
    o nowych komentarzach
Neratin
Neratin
  • 4
Treść przeznaczona dla osób powyżej 18 roku życia...
  • Odpowiedz

  • Otrzymuj powiadomienia
    o nowych komentarzach
Barteky
Barteky
  • 1
#biologia #bioinformatyka #dna #genetyka
Uczę się do kolokwium z Bioinformatyki i mam mała zagwozdkę. Treść zadania:

"W oparciu o podaną tabelę kodu genetycznego zmodyfikuj daną sekwencje DNA każdorazowo wprowadzając zmian tak, aby zawierała mutację jednonukleotydową a) cichą/ b) synonimiczną / c) niesynonimiczną / d) nonsens. Opisz, na czym polega ten typ mutacji. Przyjmij założenie, że właściwa ramka odczytu to +1 i przedstawia ona pełną sekwencję białka.
Sekwencja
  • 4
  • Odpowiedz

  • Otrzymuj powiadomienia
    o nowych komentarzach
WistfulJesus
  • 2
@Barteky: +1, czyli zaczynasz od ATG, +2 czyli zaczynasz czytac od TGC, +3 czytasz od GCT. Analogicznie dla nici przeciwnej masz -1, -2 i -3, czyli lacznie sześć ramek odczytu. Z tym, ze nalezy pamietac ze czytajac od tylu robimy reverse complement, czyli zamiast AAG robimy TTC w ramce -1. No ale tu w zadaniu jest naprostszy mozliwy scenariusz, czyli +1. Powodzenia na kolokwium :)
  • Odpowiedz
Barteky
Barteky
  • 0
@WistfulJesus: Poitechnika Poznańska, dostaliśmy slajdy od prowadzącej a oprócz tego polecali nam

1. P.G.Higgs, T.K.Atwood. Bioinformatyka I ewolucja
molekularna. PWN. Warszawa. 2012.
2. J.Xiong. Podstawy bioinformatyki. Wyd.
Uniwersytetu Warszawskiego.
  • Odpowiedz
diszpetri
  • 3
Mireczki potrzebuję jakiś kurs #python albo #linux coby poprawić swoje skille związane z #bioinformatyka. Preferuję internetowe, ale może ktoś poleci także coś stacjonarnego na terenie PL? Głównie analizy NGS, metagenomika, trankryptomika (QIIME, DADA2 itp). W obu przypadkach jestem zdecydowanie entry level - umiem napisać proste programy w PyCharm plus ogarniam konsolę w linuxie i proste skrypty. Taguję jeszcze #programowanie może ktoś miał styczność
  • 1
  • Odpowiedz

  • Otrzymuj powiadomienia
    o nowych komentarzach
FearFactory
  • 1
Jest na sali ktoś zajmujący się bioinformatyką? Przyszłościowy zawód, czy taki na marginesie? Da radę znaleźć po studiach pracę? Z tego co się dowiedziałem to dość wąska specjalizacja. Interesuję się zarówno informatyką(programowanie) jak i biologią molekularną, a zaraz będę wybierał studia i wydaję mi się po kilku wykładach znalezionych w Internecie, że jest coś fajnego. Jak to jest? #bioinformatyka #studia
  • 7
  • Odpowiedz

  • Otrzymuj powiadomienia
    o nowych komentarzach
AnonimoweMirkoWyznania
  • 0
w: 1 albo 2. Dla bioinformatyków nie ma w Polsce pracy, miały powstać ośrodki badawcze, instytuty naukowe - ale nie powstały. No, chyba, że chcesz pracować za granicą - ale wtedy musisz być naprawdę dobry, lepszy niż tamtejsi absolwenci. Nie możesz zdawać na kilka kierunków, i potem zadecydować?

To jest anonimowy komentarz.
Zaakceptował: Asterling
  • Odpowiedz
levil
  • 2
#programowanie #cpp #algorytmy #bioinformatyka
kolejny post z cyklu jestem w dupie bo obijałem się przez cały semestr ( ͡° ʖ̯ ͡°) nie wiedzieć czemu ( ͡° ʖ̯ ͡°). Zadanie wygląda następująco: http://www.cs.put.poznan.pl/mkasprzak/akb/zad4.html
mój kod: http://pastebin.com/mJxSH2ZL
i teraz jak widzicie nie działa, nie wiem czemu nie wraca pomimo znalezienia błędnego rozwiązania. ma ktoś jakieś uwagi ?
  • 15
  • Odpowiedz

  • Otrzymuj powiadomienia
    o nowych komentarzach
lionbest
  • 1
@levil: Sory ze się czepiam, ale wszędzie korzystasz z WielkosZbioru zamiast poprostu z zbior.size() a nie widzę problemów byś miał jakieś rożne rozmiary, zamiast:

int ZnajdzMaxWartosc(int c, vector tab)

zrób:

int ZnajdzMaxWartosc(vector const&
  • Odpowiedz

Powiązane tagi