Model OptiPrime przewiduje efektywność edycji prime editing, uwzględniając mechanizm naprawy DNA. 🧫

W Nature Biotechnology zespół Davida Liu przedstawia OptiPrime - model uczenia maszynowego oparty na mechanizmach prime editing. Osiąga najwyższą dokładność w przewidywaniu efektywności edycji i wyników wariantów PE3 i twinPE, uwzględniając m.in. naprawę niedopasowań (MMR). Potrafi proponować ciche mutacje omijające MMR, co podnosi skuteczność edycji. W testach w komórkach ludzkich i mysich oraz w mózgu myszy z mutacją KIF1A skorygował patogenną
uzior - Model OptiPrime przewiduje efektywność edycji prime editing, uwzględniając me...

źródło: card

Pobierz
  • Odpowiedz
  • Otrzymuj powiadomienia
    o nowych komentarzach

Pojedyncza zmiana w genie Neurexin1α osłabia zdolność mózgu do powstrzymania się od reakcji na dźwięk. 🧠

Zespół z Uniwersytetu Pensylwanii zbadał neurony w ogonie prążkowia - podkorowym węźle sensorycznym mózgu. U myszy wykonujących zadanie słuchowe Go/NoGo obie klasy neuronów kolczystych reagowały na dźwięki, ale tylko neurony szlaku pośredniego utrzymywały długotrwałą aktywność, gdy zwierzę słyszało ton nakazujący powstrzymanie akcji. Wyciszenie tej aktywności chemogenetycznie zwiększyło liczbę błędów - myszy reagowały na sygnały, które powinny zignorować.
uzior - Pojedyncza zmiana w genie Neurexin1α osłabia zdolność mózgu do powstrzymania ...

źródło: card

Pobierz
  • Odpowiedz
  • Otrzymuj powiadomienia
    o nowych komentarzach

W nie-dzielących się kardiomiocytach człowieka udało się precyzyjnie skorygować mutację przy użyciu edycji genomu bez matrycy homologicznej. 🧫

REPLACE używa dwóch gRNA do wycięcia wadliwego fragmentu i NHEJ do wstawienia dawcy bez ramion homologicznych. W pierwotnych mysich hepatocytach osiągnięto 35% skuteczność wymiany egzonu. W wątrobie dorosłych myszy, dostarczając składniki za pomocą eVLPs i AAV, uzyskano ~20% edycji. W zygotach wymieniono 27 kb region Ace2. W post-mitotycznych kardiomiocytach pacjenta skorygowano mutację LMNA, przywracając ekspresję
uzior - W nie-dzielących się kardiomiocytach człowieka udało się precyzyjnie skorygow...

źródło: card

Pobierz
  • 1
  • Odpowiedz
  • Otrzymuj powiadomienia
    o nowych komentarzach

Niemal 100 różnych mutacji w genie RHO prowadzi do tej samej dziedzicznej ślepoty, uniemożliwiając terapię celowaną w jedną zmianę. 🧫🩺

Zespół użył nukleaz z palcami cynkowymi ZF-ND1, aby przeciąć DNA w rejonie 5'-UTR genu RHO. Przez HITI (integrację niezależną od homologii) wprowadził terapeutyczny gen do pręcików. Dwa wektory AAV5 podane podsiatkówkowo u szczurów utrzymały grubość warstwy jądrowej zewnętrznej oka przez 6 miesięcy. U makaka odsetek skorygowanych pręcików przekroczył 20% - próg skuteczności (preprint,
uzior - Niemal 100 różnych mutacji w genie RHO prowadzi do tej samej dziedzicznej śle...

źródło: card

Pobierz
  • Odpowiedz
  • Otrzymuj powiadomienia
    o nowych komentarzach

Najsilniejszy genetyczny czynnik ryzyka choroby Alzheimera został precyzyjnie zamieniony na wariant ochronny. 🧫🩺

Z użyciem edytora prime editor 7 (PE7) i zoptymalizowanego pegRNA skorygowano allel APOE4 do neutralnego APOE3 w neuronach myszy i ludzkich. Edycja zachodziła specyficznie, bez wykrywalnych efektów niecelowanych. U myszy z APP/APOE4 obniżyła poziom ApoE4, akumulację Aβ42, fosforylację tau i aktywność szlaku ERK1/2, poprawiając przeżycie neuronów i funkcje poznawcze. To samo działanie potwierdzono w indukowanych neuronach od pacjentów z APOE3/4.

Po
uzior - Najsilniejszy genetyczny czynnik ryzyka choroby Alzheimera został precyzyjnie...

źródło: card

Pobierz
  • 1
  • Odpowiedz
  • Otrzymuj powiadomienia
    o nowych komentarzach

Bakteryjne nanomaszyny wstrzykują wybrane białka do komórek roślinnych z wydajnością ponad 75%, gdy zwiększy się dostępność receptora FLS2. 🧫⚗️

W preprintzie (oczekuje recenzji) badacze przekierowali system PVC z Photorhabdus na roślinny receptor FLS2, modyfikując włókna ogonkowe. Nanomaszyny dostarczyły do protoplastów rzodkiewnika rekombinazę Cre (do 15% skuteczności) oraz edytor genomu R2, który precyzyjnie wstawił reporter mCherry. W liniach nadprodukujących FLS2 odsetek trafionych komórek liści przekroczył 75%.

Otwiera to drogę do celowanej, bezDNA-wej inżynierii genomu roślin
uzior - Bakteryjne nanomaszyny wstrzykują wybrane białka do komórek roślinnych z wyda...

źródło: card

Pobierz
  • 3
  • Odpowiedz
  • Otrzymuj powiadomienia
    o nowych komentarzach

Nowotwory krwi diagnozuje się dziś średnio w 7 - 14 dni, przez serię oddzielnych badań. Lamprey robi to w kilka minut, jednym testem. 🩺🤖

To głęboki klasyfikator oparty na metylacji DNA, wyszkolony na 8544 pacjentach. Rozróżnia 86 typów nowotworów hematologicznych z dokładnością >98% - działając bezpośrednio z danych sekwencjonowania nanoporowego. Koszt: 82 dolary za próbkę.

Jeden test zastępuje morfologię, immunofenotypowanie, cytogenetykę i biologię molekularną. Diagnoza w jeden dzień, dostępna nawet w ośrodkach bez zaawansowanego
uzior - Nowotwory krwi diagnozuje się dziś średnio w 7 - 14 dni, przez serię oddzieln...

źródło: card

Pobierz
  • Odpowiedz
  • Otrzymuj powiadomienia
    o nowych komentarzach

OŚMIORNICE I INNE GŁOWONOGI EDYTUJĄ SWOJE GENY: Science 6 April 2017

Ośmiornice edytują swoje geny, wpływające na kształt RNA w celu dostosowania swojej fizjologii i morfologii (budowy ciała) w odpowiedzi na wymogi środowiska. Nowy, wspaniały przykład dostosowywania w ramach normy reakcji na środowisko (ewolucji kontrolowanej lub naturalnej biotechnologii komórkowej). Tego typu mechanizmy są mylnie interpretowane przez neodarwinistów i przypisywane przypadkowej ewolucji (https://bioslawek.files.wordpress.com/2015/02/zrzut-ekranu-z-2015-02-19-211825.png?w=1094&h=824).

Są to jednak wyrafinowane procesy o cechach zaawansowanego technicznie projektu,
bioslawek - OŚMIORNICE I INNE GŁOWONOGI EDYTUJĄ SWOJE GENY: Science 6 April 2017

O...

źródło: comment_rfv8kkZlNJ2f873xgDRGE5ewPQZUxyK5.jpg

Pobierz
  • Odpowiedz
  • Otrzymuj powiadomienia
    o nowych komentarzach

OŚMIORNICE EDYTUJĄ SWOJE GENY: Science 6 April 2017

Ośmiornice edytują swoje geny, wpływające na kształt RNA w celu dostosowania swojej fizjologii i morfologii (budowy ciała) w odpowiedzi na wymogi środowiska. Nowy, wspaniały przykład dostosowywania w ramach normy reakcji na środowisko (ewolucji kontrolowanej lub naturalnej biotechnologii komórkowej). Tego typu mechanizmy są mylnie interpretowane przez neodarwinistów i przypisywane przypadkowej ewolucji (https://bioslawek.files.wordpress.com/2015/02/zrzut-ekranu-z-2015-02-19-211825.png?w=1094&h=824).

Są to jednak wyrafinowane procesy o cechach zaawansowanego technicznie projektu, które są sterowane
bioslawek - OŚMIORNICE EDYTUJĄ SWOJE GENY: Science 6 April 2017




Ośmiornice e...

źródło: comment_laa9gjSJKat9KWwPKTD2M6z7RPTr1gyz.jpg

Pobierz
  • 11
  • Odpowiedz
  • Otrzymuj powiadomienia
    o nowych komentarzach