[krak]

Jak wykrywa się nowe mutacje wirusów? Skąd wiemy że mamy do czyniania z jego nową mutacją? Jakie zmiany muszą nastąpić w jego genomie (!?) aby mówić o nowej mutacji?
Pytam pod kątem nowej mutacji wykrytej gdzieś koło Suwałk. Poważnie każda próbka jest analizowana pod kątem nowej mutacji?! Sekwencjonowanie DNA - czy jak to się tam zwie (może nawet nie mam racji) ?
Zawołam też @dkm17 i @LukaszLamza
#medycyna #coronavirus #nauka #biologia #wirusologia

[nm00]

@krak: jeśli chodzi o to skąd wiemy- mutacja brytyjska spowodowana jest pęknięciem jednego wiązania wodorowego w kolcu i wtedy już widać że struktura jest inna, ale jak to wykrywają to nie wiem

[Polanin]

@krak: @nm00: @krak: @nm00: sekwencjonują genom. Metod jest kilka. Ta chyba najlepsze to w dużym uproszczeniu puszczanie nici DNA/RNA przez nanopory. Nić, żeby przez nie przelecieć musi się rozprostować. Na wylocie ustawiasz detektor, który wykrywa jaki kolejno kwas wychodzi przy pory. Metoda dość droga i wolna.
Inna to pocięcie łańcuchów DNA/RNA przez odpowiedni enzym. Enzym tnie łańcuchy w określonych miejscach na różną długość. Te same łańcuchy - te

[Polanin]

wiązania wodorowego w kolcu i wtedy już widać że struktura jest inna

@nm00: Jak struktura jest inna to może da się to zrobić mikroskopią elektronową, ale nie wiem czy tak łatwo da się wydzielić/znaleźć wirus.

[krak]

@Polanin: I każdy test przepuszczają przez to?!

[Polanin]

@krak: Nie. Albo wyrywkowo, albo inne objawy. Może też czasem wychodzi na testach antygenowych, ale głowy nie dam.

[kundziukundziu]

@krak: Nie, ale jest sporo aktywnych projektów sekwencjonowania próbek wirusa od pacjentów - to dzieje się ww tle całej służby zdrowia bo robą to specjalistyczne laboratoria. Mamy już między innymi projekt monitorowania zmienności genetycznej SARS-CoV-2 w Polsce - http://sarswpolsce.pl/