M.....i
M.....i
Robił ktoś ostatnio analizę filogenetyczną? Ostatni raz miałem to na studiach X lat temu, gdzie na topie było NJ i UPGMA. Wyczytałem jednak, że są błędogenne i nie uwzględniają powiązań ewolucyjnych. Stąd lepiej iść w Maximum likelihood, ale nie mam z tym doświadczenia. Co z alignmnentem? ClustalW też poszedł do lamusa?
#biologia
#bioinformatyka
#nauka
#filogenetyka
  • Najlepsze
  • Wszystkie komentarze
M.....i
M.....i
@WistfulJesus tak też uczynilem, dzięki
WistfulJesus
@Mastahbabuni: do alignmentu MAFFT albo MUSCLE, ewentualnie T-COFFE. Do analizy ML np. RAxML-ng
bioslawek
bioslawek
Czy EWOLUCJA KONTROLOWANA mogła wyewoluować z EWOLUCJI PRZYPADKOWEJ?

Trafiłem na pewne opracowanie. Jakoś pdf mi się otworzył na strinie po tej z podpisem autora, więc doszedłem do wniosku, że to robota początkującego studenta biologii. Jak się okazało znanego profesora (Tutaj: http://www.igib.uw.edu.pl/files/6814/7556/1089/ME1_wykad1_16.pdf )
Nie chce mi się krytykować wszystkich jego komentarzy (a jest się do czego przyczepić), więc skoncentruję się na podstawowym zarzucie. Ostatnio w literaturze naukowej pojawiło się bardzo dużo prac krytycznie odnoszących
  • Najlepsze
  • Wszystkie komentarze
LukaszLamza
Oooooo, kreacjoniści na wykopie, jak mogłem to dotychczas przegapić. :) I to chyba nawet sam KK we własnej osobie. Serdecznie pozdrowienia od dawnego rozmówcy z czasów Usenetu. :)
LukaszLamza
@bioslawek: Oczywiście, że pamiętam. Ja też jestem w ogóle bardzo pamiętliwy. Pozdrawiam!
DrKittens
Drzewo życia w wysokiej rozdzielczości

#biologia #taksonomia #filogenetyka
  • Najlepsze
  • Wszystkie komentarze
mroz3
@DrKittens: exquisite
piotrfelix
@DrKittens: Bardzo ładny zegar. #maciejpsuje