To, że koronawirus jest w Polsce, to to jest wiadome. Kiedy my chodzimy sobie po galeriach, jakieś dziadki i babcie kaszląc rozprzestrzeniają na nas dalej tego okropnego wirusa, więc...
Co powinniśmy robić, żeby nie zostać zarażonym, oprócz rady jaką jest niewychodzenie z domu? Czy macie jakieś badania naukowe ukazujące w jaki sposób się bronić przed tym wirusem? Czy na przykład noszenie masek przeciwsmogowych też chroni przed rozprzestrzenieniem się tego wirusa? W jakiPokaż całość

Publikacje na temat nowego wirusa zagęszczają się, tylko do samego The Lancet czeka w kolejce kilkanaście preprintów. Powybierajmy więc najciekawsze.

* JAMA publikuje krótką pracę w formie listu opisującego przypadek rodzinnej grupy zachorowań w Anyang. Na podstawie objawów i testów PCR zdiagnozowano wirusa u pięciu członków rodziny. Najbardziej interesujące jest jednak to, że jak wskazują wszystkie zebrane informacje, zarazili się oni od szóstej osoby, u której chorobę wykryto tylko testami genetycznymi, bo byłaPokaż całość

Czy dzieci chorują na nowego chińskiego koronawirusa?
* Pojawiła się mała analiza danych klinicznych 34 dzieci zdiagnozowanych w Shenzhen między 19 stycznia a 7 lutego, w wieku od 11 miesięcy do 8 lat. Większość została zbadana w związku z zachorowaniami u bliskich krewnych i 8% w dniu badania nie miało żadnych objawów, a 26% lekkie. W przebiegu leczenia nie było przypadków stanu krytycznego ani ciężkiego. W 82% przypadków poziom białych krwinek był wPokaż całość

Halo Mirki, udało się!

#ukryteterapie #jerzyzieba #koronawirus #koronawirusfakty

Czy są już jakieś publikacje na temat leków na nowego wirusa? Trochę jest, i to nawet w niezłych czasopismach.
Ostatni artykuł z The Nature opisuje testy in-vitro sprawdzające, jakie leki o działaniu ogólno-przeciwwirusowym hamują replikację koronawirusa na preparacie komórek..

Użyto tu komórek nabłonkowych z linii Vero E6, standardowo używanej przy produkcji szczepionek na ludzkie wirusy, oraz kilku leków przeciwwirusowych - rekomendowanych przez FAD rybawiryny, penciloviru, nitazoxanidu, nafamostatu i chlorochiny, oraz dwóch nowych remdesivir iPokaż całość

W ramach przeglądu prac na temat nowego koronawirusa warto też przyjrzeć się ostatnio głośnej wydłużającej czas inkubacji. Jest z nią ten problem, że akurat w tej palącej kwestii nie podaje żadnych szczegółów.

Jest to preprint umieszczony w repozytorium jeszcze przed pracami redakcyjnymi w czasopiśmie, jakie ma go opublikować. Oznacza to, że nie przeszedł procesu recenzji i ewentualnego poprawiania błędów. Miejsca takie prezentują wstępne wersje prac dla zabezpieczenia pierwszeństwa oraz dla wywołania dyskusjiPokaż całość

Minęło trochę czasu, czas więc na przegląd publikacji naukowych na temat wirusa z Wuhanu, pod tagiem #koronawirusfakty
Na obrazku: sposób uporządkowania genomów betakoronawirusów z pierwszej publikacji.

* Kompletna charakterystyka genomu nowego wirusa, z wyróżnieniem genów i domen w ich obrębie. Autorzy zauważają, że domena orf3b w obrębie genu kodującego białka sterujące replikacją, jest w nowym wirusie całkiem odmienna od innych koronawirusów i koduje całkiem nowe białko. Domena ta, ale o innej sekwencji,Pokaż całość

Przeanalizowałem słynną ostatnio pracę wiążącą genom wirusa z Wuhan z wirusem HIV przez porównywanie sekwencji aminokwasów kodowanych białek. Jest z nią dość dużo problemów, które pozwalają podważyć wnioski, ale ich zreferowanie to trochę dłuższy tekst, więc dodałem go jako znalezisko.
https://www.wykop.pl/link/5319095/czy-nowy-koronawirus-powstal-z-krzyzowki-z-wirusem-hiv/
Tu tylko wyliczę w punktach kłopotliwe fragmenty pracy:
- Znaleziono cztery fragmenty identyczne w nowym koronawirusie i w HIV, wnioskiem było, że to mało prawdopodobne, aby był to przypadek. Problem w tym, żePokaż całość

Analizuję teraz tę głośnią pracę wiążącą koronawirusa w HIV. Rany, ile to ma błędów. Nikt poważny tej pracy nie opublikuje. Wyjaśnienie tego wszystkiego będzie jednak trochę długie, więc chyba wrzucę to gdzieś i dodam jako znalezisko.
#koronawirusfakty

W związku z publikacją kilku wersji genomu nowego wirusa, zaczynają pojawiać się analizy porównawcze. Jest więc trochę danych odnośnie możliwych źródeł i sposobów zarażania.

* Na serwisie GISAID są powoli publikowane dane na temat wyizolowanych genomów. To baza pozwalająca wymieniać się określonymi sekwencjami i pierwotnie powstała aby koordynować komunikację w sprawie badań nad nowymi szczepami grypy. Pełna baza danych jest dostępna dla zarejestrowanych użytkowników (jeśli dobrze rozumiem, trzeba być naukowcem aby uzyskać dostęp).Pokaż całość

Mapa zakażeń, zgonów i wyleczeń koronawirusem. Wyleczenia przewyższają lekko śmierci.

#2019ncov #koronawirus #koronawirusfakty #gruparatowaniapoziomu

Tym raczej bardziej przemyślenia na temat epidemii, bo danych na razie wciąż mało

Określenie stopnia śmiertelności choroby w trakcie trwania epidemii jest trudne. W zasadzie nie mając danych na temat większej grupy obserwowanej od początku do końca, dysponujemy tylko współczynnikiem "liczba zgonów/liczba przypadków", który w takiej chwili mniej nam mówi o faktycznej groźności choroby, a więcej o stosunku przyrostu ofiar do szybkości rozprzestrzeniania. W sytuacji, gdy jeszcze 70-80% chorych pozostaje chorymi, liczenie wskaźnikaPokaż całość