Repozytorium MedrXiv publikuje dziś dość ciekawy preprint - artykuł naukowy w wersji przed redakcją przez docelowe czasopismo. Badacze z Iranu donoszą o wykryciu przez nich zastanawiającej korelacji: wraz z postępującą epidemią COVID-19 zaczęto coraz częściej zgłaszać im zaburzenia węchu i smaku. O tym, że objaw taki pojawia się u części poza tym faktem asymptomatycznych chorych, już donoszono z innych krajów, ale były to pojedyncze przypadki. Tutaj autorzy podsumowują dane zebrane od 15Pokaż całość

Jak wyglądają teraz te lekcje online? Jest jakiś zapis czy wszystko live i nie można cofnąć ani nic? co jak ktoś nie ma neta w domu? z czego ci nauczyciele korzystają?
#koronawirus #2019ncov #szkola

* Pojawiła się pierwsza większa analiza danych klinicznych chorych z Korei Południowej. Ze względu na bardzo dużą ilość testów w populacji, wyłapano wiele przypadków o słabo wyrażonych objawach, które inaczej mogłyby być przeoczone, więc koreańskie statystyki wydają się pełniej ujmować sytuację. Zapewne głównie to, czyli wykrycie przypadków skąpoobjawowych i asymptomatycznych, wraz z wykrywaniem wielu w okresie inkubacji a nie dopiero po zgłoszeniu się do szpitala powoduje, że jak na razie śmiertelność wPokaż całość

Najlepsza szczepionka na koronawirusa - ide sie wreszcie umyć po ponad tygodniu niemycia
#epidemia #koronawirus #2019ncov

Układanka faktów w sprawie włoskiej epidemii zaczyna się układać w pewien intrygujący obrazek. W bazie danych genetycznych GISAID, której część danych jest publicznie dostępna, opublikowano już pierwsze wyniki na temat włoskich szczepów nowego koronawirusa. Najbardziej interesujące jest drzewo filogenetyczne, pokazujące pokrewieństwa między szczepami izolowanymi w różnych miejscach. Można po tym zgadywać potencjalne drogi szerzenia wirusa oraz oceniać liczbę zmian genetycznych. Im więcej rozgałęzień prowadzi po drodze do danego szczepu, tym więcej zaszłoPokaż całość

Czas na kolejny przegląd artykułów naukowych o nowym koronawirusie
* Chińczycy zaczęli stosować eksperymentalny lek przeciwwirusowy. Chińskie czasopismo medyczne opublikowało ogólne zalecenia dla lekarzy chcących wprowadzić lek do terapii, podane są dawki, czas leczenia i przeciwwskazania.
Chodzi tu o chlorochinę, stary lek przeciwmalaryczny, który w publikacji sprzed trzech tygodni wykazał się wysoką aktywnością przeciwko replikacji. Próby kliniczne jeszcze trwają, formalnie wyniki końcowe jeszcze nie zostały opublikowane, ale ze wstępnych danych wynika, że efektyPokaż całość

Publikacje na temat nowego wirusa zagęszczają się, tylko do samego The Lancet czeka w kolejce kilkanaście preprintów. Powybierajmy więc najciekawsze.

* JAMA publikuje krótką pracę w formie listu opisującego przypadek rodzinnej grupy zachorowań w Anyang. Na podstawie objawów i testów PCR zdiagnozowano wirusa u pięciu członków rodziny. Najbardziej interesujące jest jednak to, że jak wskazują wszystkie zebrane informacje, zarazili się oni od szóstej osoby, u której chorobę wykryto tylko testami genetycznymi, bo byłaPokaż całość

Czy dzieci chorują na nowego chińskiego koronawirusa?
* Pojawiła się mała analiza danych klinicznych 34 dzieci zdiagnozowanych w Shenzhen między 19 stycznia a 7 lutego, w wieku od 11 miesięcy do 8 lat. Większość została zbadana w związku z zachorowaniami u bliskich krewnych i 8% w dniu badania nie miało żadnych objawów, a 26% lekkie. W przebiegu leczenia nie było przypadków stanu krytycznego ani ciężkiego. W 82% przypadków poziom białych krwinek był wPokaż całość

Czy są już jakieś publikacje na temat leków na nowego wirusa? Trochę jest, i to nawet w niezłych czasopismach.
Ostatni artykuł z The Nature opisuje testy in-vitro sprawdzające, jakie leki o działaniu ogólno-przeciwwirusowym hamują replikację koronawirusa na preparacie komórek..

Użyto tu komórek nabłonkowych z linii Vero E6, standardowo używanej przy produkcji szczepionek na ludzkie wirusy, oraz kilku leków przeciwwirusowych - rekomendowanych przez FAD rybawiryny, penciloviru, nitazoxanidu, nafamostatu i chlorochiny, oraz dwóch nowych remdesivir iPokaż całość

W ramach przeglądu prac na temat nowego koronawirusa warto też przyjrzeć się ostatnio głośnej wydłużającej czas inkubacji. Jest z nią ten problem, że akurat w tej palącej kwestii nie podaje żadnych szczegółów.

Jest to preprint umieszczony w repozytorium jeszcze przed pracami redakcyjnymi w czasopiśmie, jakie ma go opublikować. Oznacza to, że nie przeszedł procesu recenzji i ewentualnego poprawiania błędów. Miejsca takie prezentują wstępne wersje prac dla zabezpieczenia pierwszeństwa oraz dla wywołania dyskusjiPokaż całość

Minęło trochę czasu, czas więc na przegląd publikacji naukowych na temat wirusa z Wuhanu, pod tagiem #koronawirusfakty
Na obrazku: sposób uporządkowania genomów betakoronawirusów z pierwszej publikacji.

* Kompletna charakterystyka genomu nowego wirusa, z wyróżnieniem genów i domen w ich obrębie. Autorzy zauważają, że domena orf3b w obrębie genu kodującego białka sterujące replikacją, jest w nowym wirusie całkiem odmienna od innych koronawirusów i koduje całkiem nowe białko. Domena ta, ale o innej sekwencji,Pokaż całość

Przeanalizowałem słynną ostatnio pracę wiążącą genom wirusa z Wuhan z wirusem HIV przez porównywanie sekwencji aminokwasów kodowanych białek. Jest z nią dość dużo problemów, które pozwalają podważyć wnioski, ale ich zreferowanie to trochę dłuższy tekst, więc dodałem go jako znalezisko.
https://www.wykop.pl/link/5319095/czy-nowy-koronawirus-powstal-z-krzyzowki-z-wirusem-hiv/
Tu tylko wyliczę w punktach kłopotliwe fragmenty pracy:
- Znaleziono cztery fragmenty identyczne w nowym koronawirusie i w HIV, wnioskiem było, że to mało prawdopodobne, aby był to przypadek. Problem w tym, żePokaż całość

Tym raczej bardziej przemyślenia na temat epidemii, bo danych na razie wciąż mało

Określenie stopnia śmiertelności choroby w trakcie trwania epidemii jest trudne. W zasadzie nie mając danych na temat większej grupy obserwowanej od początku do końca, dysponujemy tylko współczynnikiem "liczba zgonów/liczba przypadków", który w takiej chwili mniej nam mówi o faktycznej groźności choroby, a więcej o stosunku przyrostu ofiar do szybkości rozprzestrzeniania. W sytuacji, gdy jeszcze 70-80% chorych pozostaje chorymi, liczenie wskaźnikaPokaż całość

Pojawiło się jeszcze trochę publikacji na temat nowego wirusa.

* Na początek wymienić można artykuł odkrywców wirusa, którzy opisali jego cechy na podstawie próbek od trzech osób z pierwotnego klastra. Nie ma tam w sumie nic nowego, może jakiś genetyk coś z tego dla siebie wyciągnie:
https://www.nejm.org/doi/full/10.1056/NEJMoa2001017?query=featured_coronavirus
Na obrazku: cząstki wirusa pod transmisyjnym mikroskopem elektronowym oraz obraz pokazujący komórki płuc wypełnione wirusami.
https://www.nejm.org/na101/home/literatum/publisher/mms/journals/content/nejm/0/nejm.ahead-of-print/nejmoa2001017/20200128/images/img_xlarge/nejmoa2001017_f3.jpegPokaż całość

Pamiętajmy też, że osoby, które umierają na ten wirus, mają ponad 58 lat. Poza tym, mają też choroby towarzyszące – cukrzycę, choroby nerek, serca, wątroby, płuc. #chiny #2019ncov