Aktywne Wpisy
Larsberg +18
Dlaczego w Polsce panuje przekonanie że autem z małą ilością koni nie da się normalnie jeździć? Użytkownik @Adamfabiarz łamie ten stereotyp poruszając się swoją 60 konną Fabią w kombii po autostradach powodując w ten sposób ból dupy wykopków mających po kilka razy więcej koni w swoich rydwanach ale niemogących ich w legalny sposób wykorzystać (limit 140 km/h sprawia że wszyscy niezależnie od mocy są równi)
#samochody #motoryzacja
#samochody #motoryzacja
źródło: Adam Grzybiarz jedzie
Pobierz
JanDzbanPL +27
Polacy najwięcej krzyczą o braku wdzięczności z strony ukraincow, jak widać Polska nawet nie jest w top 3 a krzyczymy jakbyśmy sami uratowali Ukrainę przed zagładą #ukraina
źródło: IMG_20240427_122344
Pobierz
1. na stronie gromacsa
http://www.gromacs.org/Downloads/User_contributions/Other_software
jest program topolbuild1_3, który potrafi wygenerować topologie i wszystko inne co gromacs potrzebuje na podstawie pliku mol2
2. fajnie ale program ma dość specyficzne wyobrazenie o mol2. Zwyklły format mol, jak opisane tutaj http://www.nonlinear.com/progenesis/sdf-studio/v0.9/faq/sdf-file-format-guidance.aspx nie działa
3. mol2 wygenerowany przez babel:
babel ccc.smi --gen3D dd.mol2
(smi to plik ze smiles, nie znalazłem aby można było po prostu wstawić smilesa jako argument)
też nie działa. Znaczy prawie działa - trzeba dodać w ostatniej linii @
4. komenda:
./src/topolbuild -n dd -dir ./dat/gromacs/ -ff oplsaa
wygląda, że działa. Wynik wygląda na rozsądny. Sukces.
#gromacs #topologia #babel #smiles #mol