zaltar
Czy ktoś wie dlaczego profil Polaki Biedaki Cebulaki spadł z rowerka?
#testoviron #polakicebulaki #pbc
1
  • Najlepsze
  • Wszystkie komentarze
Trajforce
Treść przeznaczona dla osób powyżej 18 roku życia...
3
nietopies
@zaltar: Bo mnie obraża?
0
rmrmg
rmrmg
O wypełnieniu pudła wodami za pomocą gromacsa.
0. gromacs zakłada, że pudło jest [0,x], [0,y] [0,z] czyli trzeba zadbać o to aby cząsteczka była w rozsądnym miejscu (skrypt movexyz.py przesuwa molekułę)

1. strukturę w .xyz trzeba przerobić na .gro skrypt xyztogro.py to robi jakby się zgubił to to co w nim istotne pochodzi z dokumentacji gromacsa:
print "%5d%-5s%5s%5d%8.3f%8.3f%8.3f" %(resid,resnam,atom,licz,x,y,z)
Tak ma wyglądać linia opisująca atom. Pierwsza linia to komentarz, druga to liczba atomow a ostatnia
2
PokeMan
2