Wpis z mikrobloga

W ostatnich dniach w pewnych kręgach znowu krąży plotka o rzekomym wcofaniu czy rezygnacji z testów RT-PCR przez amerykańskie CDC. Pogląd bierze się z niezrozumienia tego komunikatu:
https://www.cdc.gov/.../07-21-2021-lab-alert-Changes_CDC...
Nie ma mowy o "wycofaniu testów PCR" jako takich. Chodzi o jeden konkretny produkt, opracowany akurat przez CDC, o nazwie "CDC 2019-nCoV Real-Time RT-PCR Diagnostic Panel".
Ten test, opracowany w lutym 2020 roku, był jednym z pierwszych na świecie testów diagnostycznych dla tego wirusa. Obecnie jest jednym z bardzo wielu testów PCR.
Komunikat został wydany w lipcu 2021 roku. Informuje z wyprzedzeniem o planowanym wycofaniu, a ściślej nie przedłużaniu wniosku do FDA o autoryzację ww. testu po 31.12.2021. Proponuje laboratoriom korzystającym z tego testu przestawienie się na jeden z wielu alternatywnych produktów, zachęca też do używania testu kompleksowego na covid i grypę jednocześnie.
Komunikat zawiera link do listy takich autoryzowanych testów, z opisem "Visit the FDA website for a list of authorized COVID-19 diagnostic methods."
Link kieruje na tą stronę FDA:
https://www.fda.gov/.../coronav.../in-vitro-diagnostics-euas
Wybieramy "Molecular Diagnostic Tests for SARS-CoV-2" > "Individual EUAs for Molecular Diagnostic Tests for SARS-CoV-2", czyli po polsku listę indywidualnych autoryzacji testów molekularnych (do takich zaliczają się testy PCR).
https://www.fda.gov/.../in-vitro-diagnostics-euas...
Pojawia się lista z 268 różnymi testami molekularnymi.
Na liście znajdujemy interesujący nas produkt. Możemy użyć pola wyszukiwania w lewym górnym rogu listy, albo w prawym górnym rogu wybrać ilość pozycji na stronie "All" czyli wszystkie, i wyszukać "ręcznie".
Na zrzucie ekranu widać, że "CDC 2019-nCoV Real-Time RT-PCR Diagnostic Panel" jest jednym z bardzo wielu dopuszczonych w USA testów molekularnych - których jest łącznie 268, i z których większość jest typu RT-PCR.
Szukanie frazy "CDC" znajduje dwa produkty: rzeczony, wycofywany właśnie test, oraz drugi, kompleksowy na covid i grypę.
Tutaj dochodzi drugi wątek plotki, że test "nie odróżnia covida od grypy". Oczywiście nie ma o tym mowy, on wykrywa wirusa SARS-CoV-2 i tyle, na wirusa grypy są odrębne testy. Albo właśnie kompleksowe, "dwa w jednym" covid plus grypa. To są dwa zupełnie inne wirusy, ale przydaje się badać jednocześnie jedno i drugie.
Pozostaje pytanie, co jest nie tak z wycofywanym testem? Czy okazał się wadliwy, niedokładny? Otóż nie, pod tymi względami nic mu nie dolega. Chodzi o ekonomię i wydajność. Nowsze testy robią to samo szybciej i taniej. Cytat z anglojęzycznego debunku plotki: "[...] the demand for this test has declined with the emergence of other higher-throughput and multiplexed assays."
https://healthfeedback.org/.../eua-withdrawal-for-cdc.../
Na marginesie: w połączeniu z zachętą do stosowania testów łączonych na covid i grypę, kiedy drugi test PCR "marki" CDC jest właśnie takim testem łączonym, cały komunikat odbieram trochę jako rodzaj reklamy tego drugiego testu
Ważna uwaga: trzeba mieć świadomość, że RT-PCR to metoda, a nie konkretny test. Znając genom wirusa każde laboratorium z odpowiednim zapleczem może opracować własny test, który będzie oparty na różnych, ale wciąż unikalnych fragmentach genomu.
https://en.wikipedia.org/wiki/COVID-19_testing...
https://pl.wikipedia.org/.../Reakcja_%C5%82a%C5%84cuchowa...
Trochę historii
Pierwsze analizy w Chinach:
"The initial laboratory screening results from patients were negative for 26 common respiratory pathogens, including influenza A and B virus, parainfluenza virus, adenovirus, respiratory syncytial virus, metapneumovirus, rhinovirus, enterovirus, and other common respiratory viruses. On January 3, 2020, the sequence of novel β-genus coronaviruses (2019-nCoV) was determined from specimens collected from patients in Wuhan by scientists of the National Institute of Viral Disease Control and Prevention (IVDC), and three distinct strains have been established"
http://weekly.chinacdc.cn/.../e3c63ca9-dedb-4fb6-9c1c...
Pierwszy genom wirusa - przesłany przez Chińczyków 05.01.2020, opublikowany 12.01.2020:
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/MN908947.1
Pierwsze wyizolowanie i hodowla komórkowa w USA, z próbki otrzymanej 20.01.2020:
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/labs/pmc/articles/PMC7258473/

OP: https://www.facebook.com/permalink.php?story_fbid=1237811910044603&id=100014474163903
#koronawirus #bekazfoliarzy
  • 2