Wszystko

Wszystkie

Archiwum

Raczkin
Raczkin
  • 0
@DarkSusan 2 lata temu I rok temu progi na UAM, to 40.20 I 42.20 +/- jeden punkt ale w tym roku wyskoczyło do 50.20, więc strasznie duża różnica względem poprzednich lat
  • Odpowiedz
M.....i
M.....i
  • 0
Robił ktoś ostatnio analizę filogenetyczną? Ostatni raz miałem to na studiach X lat temu, gdzie na topie było NJ i UPGMA. Wyczytałem jednak, że są błędogenne i nie uwzględniają powiązań ewolucyjnych. Stąd lepiej iść w Maximum likelihood, ale nie mam z tym doświadczenia. Co z alignmnentem? ClustalW też poszedł do lamusa?
#biologia
#bioinformatyka
#nauka
#filogenetyka
p.....a
p.....a
  • 1
@turkusowakoszulka: ściągasz najpierw sekwencję pierwszego i drugiego enzymu,
wchodzisz na ncbi.nlm.nih.gov/blast
wybierasz nucletotide blast
odhaczas " Align two or more sequences"
Wklejasz sekwencję pierwszą do pierwszego okienka, drugą do drugiego
i przyrównujesz, najlepiej na domyślnych ustawieniach, bo po co kombinować bardziej
  • Odpowiedz
cieliczka
cieliczka
  • 4
Proces starzenia nie jest jednostajny, a znaczące zmiany zachodzą w wieku 34, 60 i 78 lat

Tak wynika z artykułu opublikowanego w Nature Medicine, który opisuje badanie poziomu ok. 3 tysięcy białek w osoczu krwi ponad 4 tysięcy osób w wieku 18-95 lat. Tutaj znalezisko z tłumaczeniem w komentarzu opisującym badanie i jego znaczenie

#liganauki #biologia #bioinformatyka #analizadanych
cieliczka - Proces starzenia nie jest jednostajny, a znaczące zmiany zachodzą w wieku...

źródło: comment_EBW45Sblqwv4B9p8e4pd3MozPEQusOhb.jpg

Pobierz
  • Odpowiedz
AnonimoweMirkoWyznania
AnonimoweMirkoWyznania
  • 1
#anonimowemirkowyznania
Czy są tu jacyś studenci bioinformatyki?

Co sądzicie o kierunku? Trudno jest się dostać? Ciekawy jest? Jaka jest szansa znalezienia pracy w zawodzie po studiach?

#bioinformatyka

Kliknij tutaj, aby odpowiedzieć w tym wątku anonimowo
Kliknij tutaj, aby wysłać OPowi anonimową wiadomość prywatną
Post dodany za pomocą skryptu AnonimoweMirkoWyznania ( https://mirkowyznania.eu ) Zaakceptował: marcel_pijak
Dodatek wspierany przez: Wyjazdy dla młodzieży
Neratin
Neratin
  • 4
Śmiechłem srodze czytając rozważania @Brzytwa_Ockhama o czynnikach determinujących orientację seksualną.

Zacznijmy od natury homoseksualizmu. Nie znaleziono genu na homoseksualizm lub uznano badania za niewystarczające - klik


"klik" to streszczenie artykułu Rice et al z 1999 roku ( ͡° ͜ʖ ͡°)

Ja rozumiem, że jak ktoś jest naukowcem wiary, filozofem albo studentem filologii to kilkadziesiąt lat w te czy we wte nie robi mu różnicy, ale w naukach przyrodniczych
  • Odpowiedz
Barteky
Barteky
  • 1
#biologia #bioinformatyka #dna #genetyka
Uczę się do kolokwium z Bioinformatyki i mam mała zagwozdkę. Treść zadania:

"W oparciu o podaną tabelę kodu genetycznego zmodyfikuj daną sekwencje DNA każdorazowo wprowadzając zmian tak, aby zawierała mutację jednonukleotydową a) cichą/ b) synonimiczną / c) niesynonimiczną / d) nonsens. Opisz, na czym polega ten typ mutacji. Przyjmij założenie, że właściwa ramka odczytu to +1 i przedstawia ona pełną sekwencję białka.
Sekwencja wyjściowa:
ATGCTTATGAGATCGCGAGACGAA"

Ogólnie wiem o
WistfulJesus
WistfulJesus
  • 2
@Barteky: +1, czyli zaczynasz od ATG, +2 czyli zaczynasz czytac od TGC, +3 czytasz od GCT. Analogicznie dla nici przeciwnej masz -1, -2 i -3, czyli lacznie sześć ramek odczytu. Z tym, ze nalezy pamietac ze czytajac od tylu robimy reverse complement, czyli zamiast AAG robimy TTC w ramce -1. No ale tu w zadaniu jest naprostszy mozliwy scenariusz, czyli +1. Powodzenia na kolokwium :)
  • Odpowiedz
Barteky
Barteky
  • 0
@WistfulJesus: Poitechnika Poznańska, dostaliśmy slajdy od prowadzącej a oprócz tego polecali nam

1. P.G.Higgs, T.K.Atwood. Bioinformatyka I ewolucja
molekularna. PWN. Warszawa. 2012.
2. J.Xiong. Podstawy bioinformatyki. Wyd.
Uniwersytetu Warszawskiego. Warszawa. 2009.

z tymi ramkami odczytu w sumie to wiem o co chodzi tylko nie byłem pewien na 100% że to o to chodziło.
  • Odpowiedz
diszpetri
diszpetri
  • 3
Mireczki potrzebuję jakiś kurs #python albo #linux coby poprawić swoje skille związane z #bioinformatyka. Preferuję internetowe, ale może ktoś poleci także coś stacjonarnego na terenie PL? Głównie analizy NGS, metagenomika, trankryptomika (QIIME, DADA2 itp). W obu przypadkach jestem zdecydowanie entry level - umiem napisać proste programy w PyCharm plus ogarniam konsolę w linuxie i proste skrypty. Taguję jeszcze #programowanie może ktoś miał styczność i może pomóc.
FearFactory
FearFactory
  • 1
Jest na sali ktoś zajmujący się bioinformatyką? Przyszłościowy zawód, czy taki na marginesie? Da radę znaleźć po studiach pracę? Z tego co się dowiedziałem to dość wąska specjalizacja. Interesuję się zarówno informatyką(programowanie) jak i biologią molekularną, a zaraz będę wybierał studia i wydaję mi się po kilku wykładach znalezionych w Internecie, że jest coś fajnego. Jak to jest? #bioinformatyka #studia
darkemolt
darkemolt
  • 2
GoC@FAIS'16 - biotechnologia medycyna dane

Co?: Konferencja na temat danych/ich analizy w kontekście bio(technologii, informatyki, itp.)
Kiedy?: 16 XII 16
Gdzie?: Wydział FAIS UJ, ul. prof. Stanisława Łojasiewicza 11, 30-348 Kraków
Za ile?: Za darmo!

W drugiej już edycji Garażowej konferencji GoC@FAIS będziemy rozważać zagadnienia związane z danymi i ich analizą w kontekście biotechnologii, biologii, biologii syntetycznej, bioinformatyki, medycyny, służby zdrowia, farmacji i bioetyki.

Wszystko z myślą o przyszłości. Jesteśmy ciekawi jak
darkemolt - GoC@FAIS'16 - biotechnologia medycyna dane Co?: Konferencja na temat d...

źródło: comment_u3ya5GUq229FYiHtdt9svTjCnOGYi9Ul.jpg

Pobierz

Powiązane tagi