Publikacje na temat nowego wirusa zagęszczają się, tylko do samego The Lancet czeka w kolejce kilkanaście preprintów. Powybierajmy więc najciekawsze.

* JAMA publikuje krótką pracę w formie listu opisującego przypadek rodzinnej grupy zachorowań w Anyang. Na podstawie objawów i testów PCR zdiagnozowano wirusa u pięciu członków rodziny. Najbardziej interesujące jest jednak to, że jak wskazują wszystkie zebrane informacje, zarazili się oni od szóstej osoby, u której chorobę wykryto tylko testami genetycznymi, bo
Czy dzieci chorują na nowego chińskiego koronawirusa?
* Pojawiła się mała analiza danych klinicznych 34 dzieci zdiagnozowanych w Shenzhen między 19 stycznia a 7 lutego, w wieku od 11 miesięcy do 8 lat. Większość została zbadana w związku z zachorowaniami u bliskich krewnych i 8% w dniu badania nie miało żadnych objawów, a 26% lekkie. W przebiegu leczenia nie było przypadków stanu krytycznego ani ciężkiego. W 82% przypadków poziom białych krwinek był
@KubaGrom @vuxiu

Widzialem, iz bardzo konkretnie i merytorycznie poruszacie temat covid19/2019ncov. Mam pare pytan, moze rozsjasnicie sytuacje.

1. Czy covid19/2019ncov powoduje tzw. burze cytokin (podobnie jak hiszpanka w jednej ze swoich faz)
2. Na co glownie umieraja chorujacy na covid19/2019ncov? Ktore choroby wspolistniejace w najwyzszym stopniu zwiekszaja ryzyko zgonu?
3. Czy osoby, ktore wyzdrowialy uzyskuja odpornosc?
4. Czy osoby, ktore wyzdrowialy posiadaj jakies powiklania, trwale uszkodzenia narzadowe po przebyciu choroby?
5. Czy
@Nfvr: ad 5. wydaje mi się, że pytanie jest źle zadane, bo zapalenie płuc obejmuje w sobie zawsze zapalenie oskrzeli, które samo w sobie może być wstępem do zapalenia płuc, ale nie musi (w różnych innych infekcjach). Parafrazując, myślę że można mieć zapalenie oskrzeli bez zapalenia płuc, ale nie można mieć zapalenia płuc bez stanu zapalnego także w oskrzelach. Zapalenie płuc jest szerszym pojęciem po prostu, to rozwinięty stan zapalny w
@Nfvr: 1. Publikacje wprost nie używają tego terminu, ale podane parametry wysokich stężeń cytokin, nadaktywności cytotoksycznych limfocytów itp. wskazywałyby na podobny stan. Z drugiej strony im młodsi są chorzy tym słabiej reagują, dzieci mogą wręcz chorować bezobjawowo, więc nie jest to ten sam rodzaj stanu superzapalnego jak z Hiszpanką.
2. W większości przypadków nie jest to podane, ale głównie niewydolność płuc z brakiem przyswajania tlenu, prowadząca dalej do niewydolności wielonarządowej, zaburzenia
Czy naukowcy napisali ostatnio coś ciekawego o nowym koronawirusie?
* Wczorajsza publikacja z The Lancet to opis pojedynczego przypadku - pacjenta w wieku 50 lat, bez informacji o przewklekłych chorobach, który zmarł w szpitalu Bejing. Przez kilka dni (8-12 stycznia) był w Wuhan, potem wrócił do pracy. Po dwóch dniach od powrotu zaczął czuć dreszcze i nasilający się kaszel, ale bagatelizował objawy. 7 dnia choroby zaczął odczuwać gorączkę. Gdy kolejnego dnia pojawiło
KubaGrom - Czy naukowcy napisali ostatnio coś ciekawego o nowym koronawirusie?
* Wcz...

źródło: comment_1582030903UZw4BpUVSj7hOYbKMdXGuA.jpg

Pobierz
Czy są już jakieś publikacje na temat leków na nowego wirusa? Trochę jest, i to nawet w niezłych czasopismach.
Ostatni artykuł z The Nature opisuje testy in-vitro sprawdzające, jakie leki o działaniu ogólno-przeciwwirusowym hamują replikację koronawirusa na preparacie komórek..

Użyto tu komórek nabłonkowych z linii Vero E6, standardowo używanej przy produkcji szczepionek na ludzkie wirusy, oraz kilku leków przeciwwirusowych - rekomendowanych przez FAD rybawiryny, penciloviru, nitazoxanidu, nafamostatu i chlorochiny, oraz dwóch nowych
KubaGrom - Czy są już jakieś publikacje na temat leków na nowego wirusa? Trochę jest,...

źródło: comment_158147279641QDoEvmcl4kZv6tAv6REi.jpg

Pobierz
W ramach przeglądu prac na temat nowego koronawirusa warto też przyjrzeć się ostatnio głośnej wydłużającej czas inkubacji. Jest z nią ten problem, że akurat w tej palącej kwestii nie podaje żadnych szczegółów.

Jest to preprint umieszczony w repozytorium jeszcze przed pracami redakcyjnymi w czasopiśmie, jakie ma go opublikować. Oznacza to, że nie przeszedł procesu recenzji i ewentualnego poprawiania błędów. Miejsca takie prezentują wstępne wersje prac dla zabezpieczenia pierwszeństwa oraz dla wywołania dyskusji
Minęło trochę czasu, czas więc na przegląd publikacji naukowych na temat wirusa z Wuhanu, pod tagiem #koronawirusfakty
Na obrazku: sposób uporządkowania genomów betakoronawirusów z pierwszej publikacji.

* Kompletna charakterystyka genomu nowego wirusa, z wyróżnieniem genów i domen w ich obrębie. Autorzy zauważają, że domena orf3b w obrębie genu kodującego białka sterujące replikacją, jest w nowym wirusie całkiem odmienna od innych koronawirusów i koduje całkiem nowe białko. Domena ta, ale o innej sekwencji,
KubaGrom - Minęło trochę czasu, czas więc na przegląd publikacji naukowych na temat w...

źródło: comment_1581289233T7ByA1Psq0ecm9KTcIo61M.jpg

Pobierz
Przeanalizowałem słynną ostatnio pracę wiążącą genom wirusa z Wuhan z wirusem HIV przez porównywanie sekwencji aminokwasów kodowanych białek. Jest z nią dość dużo problemów, które pozwalają podważyć wnioski, ale ich zreferowanie to trochę dłuższy tekst, więc dodałem go jako znalezisko.
https://www.wykop.pl/link/5319095/czy-nowy-koronawirus-powstal-z-krzyzowki-z-wirusem-hiv/
Tu tylko wyliczę w punktach kłopotliwe fragmenty pracy:
- Znaleziono cztery fragmenty identyczne w nowym koronawirusie i w HIV, wnioskiem było, że to mało prawdopodobne, aby był to przypadek. Problem w
Analizuję teraz tę głośnią pracę wiążącą koronawirusa w HIV. Rany, ile to ma błędów. Nikt poważny tej pracy nie opublikuje. Wyjaśnienie tego wszystkiego będzie jednak trochę długie, więc chyba wrzucę to gdzieś i dodam jako znalezisko.
#koronawirusfakty
W związku z publikacją kilku wersji genomu nowego wirusa, zaczynają pojawiać się analizy porównawcze. Jest więc trochę danych odnośnie możliwych źródeł i sposobów zarażania.

* Na serwisie GISAID są powoli publikowane dane na temat wyizolowanych genomów. To baza pozwalająca wymieniać się określonymi sekwencjami i pierwotnie powstała aby koordynować komunikację w sprawie badań nad nowymi szczepami grypy. Pełna baza danych jest dostępna dla zarejestrowanych użytkowników (jeśli dobrze rozumiem, trzeba być naukowcem aby uzyskać
KubaGrom - W związku z publikacją kilku wersji genomu nowego wirusa, zaczynają pojawi...

źródło: comment_yIkitOd8fxqorVqCtEStnKlwEQKoV8Yy.jpg

Pobierz
Tym raczej bardziej przemyślenia na temat epidemii, bo danych na razie wciąż mało

Określenie stopnia śmiertelności choroby w trakcie trwania epidemii jest trudne. W zasadzie nie mając danych na temat większej grupy obserwowanej od początku do końca, dysponujemy tylko współczynnikiem "liczba zgonów/liczba przypadków", który w takiej chwili mniej nam mówi o faktycznej groźności choroby, a więcej o stosunku przyrostu ofiar do szybkości rozprzestrzeniania. W sytuacji, gdy jeszcze 70-80% chorych pozostaje chorymi, liczenie
Omawiana wczoraj praca z obserwacjami grupy 99 pacjentów z Wuhan oficjalnie się ukazała. Autorom udało się coś dopisać w trakcie procesu recenzji - w preprincie, który zamykał zbieranie danych 25 stycznia, mowa było tylko o 2 zgonach i 25 wyleczonych. W ostatecznej wersji jest 11 zgonów i 31 wyleczonych. Ponieważ z tej grupy ponad połowa wciąż była leczona, ciężko z tego wyliczać śmiertelność, w każdym razie w grupie tej raczej już nie